陶志纲陪着首长一起看美国对日本投放原子弹的视频，陶志纲见到里面爆炸的画面想起了之前在大火中牺牲的战友，差一点控制不住自己的情绪，好在首长出声打断了他的思绪。首长告诉陶志纲，给他看这个就是为了告诉他，中国准备研究属于自己的原子弹，来应对美国对他们的核威胁。首长任命陶志纲去保护中国第一个原子弹研究机构，A所。但是他必须脱下军装秘密保护，陶志纲一开始知道自己要去保护一群科学家，就有些不乐意，但最后还是接受了首长的命令。钟培林见到了孟教授，他们在一起讨论发现国内的研究环境，确实落后了美国很大一节，但是他们有信心，只要他们这一群科学家在一起一定可以超越美国。孟教授告诉钟培林，林教授已经被解救，不日就会回国，这个消息让钟培林很是高兴。小摊上，王怀民和一个小商贩谈价还价，买一个干涉滤光片，钟培林路过也见到这个滤光片，一看就知道是好东西。于是在王怀民和商贩讲价的时候，扔下钱抢过了滤光片，就跑走了，留在王怀民在原地无可奈何。钟培林去见了方明，方明将军告诉他，国家现在需要他研究一个全新的领域，并且他的名字也不会出现在任何的学术周刊上，也不能够申请诺奖，甚至不能够拥有自己真实的姓名，问这样的话，钟培林是否愿意。钟培林听了之后，虽有犹豫，但是很快就表示同意，说自己愿意以身许国，方明听了他的话很是感动，钟培林还当众宣布自己以后改名叫钟爱国。研究所的政审开始了，陶志纲因为之前对王怀民的影响不好，加上王怀民直接说出了他们研究说的目的，没有让王怀民通过政审。从地方上来的雷达方面的专家，彭雄飞赶来研究所报道，他一来就上去和抱着孩子的黄凯华打招呼，但是黄凯华因为妻子要跟自己离婚，自己要照顾孩子心情不好，没有搭理他。这时候一旁的丁向军就主动跟他打招呼。进了研究所之后，各地各方面的科学家聚在一起，才发现他们研究的专业和擅长的东西完全不一样，纷纷猜测这个研究所是干什么的。陶志纲私下去调查了王怀民的情况，发现他完全没有问题，父亲至今仍在朝鲜战场没有回来，哥哥也因为解放战争牺牲，他和妻子也是拒绝了苏联的优厚条件回国。王怀民在研究所门口拦住了钟培林的车，希望陶志纲能够重新考虑他的政审问题，但是陶志纲还是因为王怀民傲慢的态度，拒绝了他。陶志纲带着大家宣誓，然后告诉他们研究说唯一的纪律就是保密。钟培林私下想要劝陶志纲不要对王怀民有偏见，结果反而被陶志纲说的话气得不行，也只好作罢。钟心回国，钟培林去接她，父女两人紧紧地抱在一起，再也不分开。王怀民回家的路上收到了父亲的信，王父说自己一切安好，但是希望王怀民能偶重新找一个爱人。王怀民回去之后，杨佳蓉正带着振理在喂兔子。王怀民把杨佳蓉叫进房里，对她以后打算自己照顾振理，让杨佳蓉不用来帮忙了。杨佳蓉却因为对何吟薇的承诺，不肯答应，她认为王怀民根本照顾不好振理。苏联的专家过来研究说，帮助大家解决技术上的问题，其中一个专家问了两个关于美国原子弹的问题，让大家回答，这时候黄凯华回答了其中一个，但是另一个他也不知道，钟培林就感慨要是王怀民在这里，也许能够回答这个问题。