次日一早醒来，莱拉决定先去威尔的世界。那里没有教会，“尘埃”也就不会被视为原罪，禁止研究讨论。换好衣服，潘躲进背包里，莱拉和威尔来到僻静的死胡同。穿过裂隙，莱拉兴奋的冲出街心公园，很想看看这是个什么样的世界。一辆车呼啸着从她身边驶过，险些撞上。莱拉这才看到，路边停满了类似的四轮机械怪物。莱拉的世界里没有汽车，就如同威尔的世界里没有乔丹学院一样。二人小心翼翼的穿过马路，都没有注意到路边一辆毫不起眼的汽车。主教法庭执行官博雷尔诧异的看到威尔和莱拉在一起，但他并没有马上行动，还有更重要的事要做，只能把寻找约翰·佩里邮件的事暂时交给这个世界的眼线沃尔特斯警督。博雷尔返回教会时，前主教斯特罗克的葬礼已经结束。葬礼上，代理主教麦克费尔神父强烈谴责女巫行刺主教的恶行，并在之后的听审会上，将塞拉芬娜派来的求和使者定罪下狱。在选举前，他还接受库尔特夫人的建议，签下剿灭女巫法令，让他声望大涨。当晚，所有神父一致投票推举麦克费尔为新任主教。与此同时，教会飞艇投下成吨烈性炸药，将女巫小岛夷为平地。库尔特夫人心中暗喜，麦尔费尔为登大位曾有不少算计，其中不乏经过库尔特夫人之手实施。手里有了主教的把柄，也就不怕教会对自己以后的行动横加阻挠。此时，在另一个世界里，莱拉失望的看到应当是乔丹学院的地方，只是一片闲置工地。威尔要先去看望母亲，然后还要去找律师，便约定黄昏前在两个世界都有的植物园碰头。莱拉百无聊赖，看到路边博物馆海报有点乔丹学院的风格，兴匆匆前往。博物馆里陈列着各种北方遗迹，从爱斯基摩人的古老雪橇到古人类头骨。莱拉找了个无人角落，取出真理仪，问出心中的问题。从真理仪反馈的图形，她分析出要去圣彼得学院找一位院士，最重要的是，必须坦承相告。真理仪还表明，要帮助威尔找到父亲，莱拉更迷茫。不管怎么说，先抓紧时间去找院士。但实话实说能否有用，莱拉心里犯疑。背上背包向博物馆大门走去时，莱拉不经意撞上了一个人，赶紧将手里的真理仪揣进口袋，佯装参观展品的模样。那人叫查尔斯，他没想到一个十几岁的孩子会对古人类的头骨感兴趣，而且那些头骨还是他本人收藏再转赠博物馆的。莱拉谎称自己叫莉兹，随便敷衍了几句，找机会离开。一路打听来到圣彼得学院，莱拉信步走进真理仪所说的，贴有一座大山的门。门上贴的是富士山照片，门后是学院最冷门的暗物质研究所。因缺少经费而无所事事的玛丽院士听着眼前女孩说了一堆莫名其妙的名词，什么“尘埃”，“原罪”，“教会当局”，“罗杰”，“乔丹学院”，一时难以理解。但她能看出莱拉并非胡言乱语，本着科学家的研究精神，静心听莱拉解释。听了好一会，玛丽院士才明白，莱拉是想了解自己的研究项目。作为交换，莱拉也答应会解答玛丽的一些疑问后，玛丽说出了自己的研究项目，暗物质。暗物质无所不在，又很难观测。玛丽历经多年研究，才发明出用于观测的电脑设备，取名“山洞”。她观测过很多物体，发现暗物质对人造物及人类接触有反应，尤其是她收藏的易经盒。直到有一天，玛丽心血来潮，将导线连在自己头上。在思考的过程中，电脑屏幕上的波纹出现连续波动，像是要与她交流。至此，玛丽猜测出，暗物质是有自我意识的。只有当人的意识处于某种期待状态时，暗物质就会回应人的思维。由于玛丽的研究过于怪异，被学院当成异端学说，弃之不用。莱拉却恍然大悟，对真理仪的运作原理有了进一步的认识。玛丽对真理仪能视透万物仍抱有疑惑，莱拉当场用真理仪回答了她的问题，她在当科学家前是名修女，因不再相信上帝才选择离开。玛丽惊讶之余也欣喜若狂，把莱拉带到了自己的实验室。莱拉坐在玛丽开发的暗物质探测器前，电脑屏幕上的波纹纹丝不动。但当莱拉放空思想，思考问题时，波纹出现剧烈反应。屏幕上的波纹形成图案，以真理仪的图形回答莱拉的疑问。暗物质就是莱拉所说的“尘埃”，它告诉莱拉，玛丽院士很重要，必须由院士带着易经盒子去某个地方。还没等说清楚，莱拉猛然想起与威尔的约定，一边忙不迭的跑出实验室，一边随口答应明天再来，丢下心痒难挠的玛丽院士。在植物园门口等了好一会的威尔见到莱拉气喘吁吁跑来，不禁大怒。今天他先去翰威老师那看望过母亲伊莱恩，确定母亲安好后，再去找律师。他希望动用父亲的信托基金，为母亲找个安身处，再找个心理医生治疗。可威尔未成年，律师建议与另两名受托者，威尔的祖父母商量。威尔第一次听说自己有祖父母，就生活在牛津。他怀着一丝激动，按照律师提供的地址来到祖父母家。谁知刚提到信托基金，祖父就生气离开。祖母找其他话题东拉西扯，却说漏了嘴，先是说不太了解伊莱恩的情况，后又说伊莱恩急需专业治疗，威尔立刻明白，他们早与警方有默契，祖父离开说不定就是在联系警方。威尔借打翻咖啡杯逃离祖父母家，又久等莱拉不来，真害怕莱拉已被警方抓住，谁想到莱拉却是在四处游玩。莱拉心里有气，取出真理仪，让威尔见识一下比手机更厉害的事物。真理仪不论结果好坏，只说真相。从真理仪上得知，威尔的父亲约翰·佩里并没有死，而是带着一些信逃走了。有个人想偷取伊莱恩与约翰来往的邮件，被威尔撞破，跌下楼梯身亡。话说到这，威尔自然不再怀疑真理仪的真假。他现在只有信任莱拉，回喜鹊城，找出隐藏其中的奥秘。