陈云经过走访调查，提出既要坚持三面红旗，又要兼顾人民群众的生活，也要求各级干部要讲实话，不能浮夸虚假。陈云又选择了几个地区进行调研，形成《青浦调查报告》报送中央，起到了重要的作用。陈云提出要分田到户，但担心毛主席不会接受，不少人劝陈云是否再考虑一下，但陈云还是坚持分田到户，提高农民的积极性。毛主席反对分田单干，陈云的这次尝试失败了。因为心脏问题，陈云再次给中央写信，请假不参加一切会议，直到1966年，陈云都没有参加中央最高层的决策和工作。1966年，中央开会改组中央领导机构，人员和排序都有所调整，陈云排名最后一位，陈云表示没有意见。